Junto a la antigua iglesia de Guadalupe, el fundador de los sacerdotes del Verbo Divino, san Arnoldo Janssen, encargó la construcción de un nuevo templo, que encomendó al sacerdote y arquitecto, Juan Beckert, que se trasladó a Buenos Aires desde Alemania para dirigir el proyecto.

El 24 de marzo de 1901 colocaron la piedra fundamental del templo que fue costeado principalmente por la congregación desde Alemania. Fue consagrado por monseñor Espinosa el 18 de mayo de 1907, durante la vigilia de Pentecostés.

El templo es de estilo románico -en forma de cruz latina- con tres naves de cincuenta y tres metros de longitud por veinte metros de ancho, y un crucero lateral de cuarenta y tres metros. El 30 de abril de 1940, el papa Pío XII le otorgó el título de Basílica del Espíritu Santo.